秘卷和通灵作为决斗场中重要的资源,主要的作用是用来丰富战斗玩法,弥补一些忍者机制上的不足。在决斗场中,同一个秘卷根据等级的高低,在效果上也是有着不小的差异,例如一级霸体只能维持三秒,升到五级就能让持续时间提升到3.9秒,近乎一秒的差距在战斗中可能就是决胜负的关键。对于决斗场玩家来说,把常用的秘卷升到十级则是最低的要求。

一些忍者还附有专属秘卷,例如各个版本的柱间带上抓取作用的扦插,战斗中就会变为明神门,冷却上是要比原秘卷更低。带上一字连柱秘卷,实际就会变为树界降临,得到更大的范围。通灵术是固定20s的资源,大体可分为先手通灵、反手通灵以及增益类的通灵。先手通灵启动更快,前摇帧极低,例如贝壳、镰鼬都是可以作为玩家的起手技。山椒鱼、守鹤这些启动较慢但有着较大作用范围、持续时间久的通灵,则是作为反手释放。
遇到敌人替身想打反手,或是自己替身抢回节奏的时候,都是可以接这些通灵。鲨鱼、蛤蟆吉这类召唤后提升伤害的通灵,就是增益类通灵,搭配鼬、求佛哥这样的忍者,就可以进一步增加灌伤能力。少数通灵搭配特定忍者,还有着特殊效果,例如自来也带上蛤蟆仙人就可以用来驱散敌人的霸体,死三搭配猿魔则是能减少笼子的冷却,开启猿魔就能让笼子只用8S冷却即可释放。